不插管的胃肠镜检查，通常指胶囊内镜检查。检查结果与插管胃肠镜的结果一致，准确率也比较高，但是与插管胃肠镜的不同是不能通过胶囊内镜进行活检。
胶囊内镜的工作原理是通过把快速摄像机，放到胶囊一般大的小仪器里，通过吞服使小胶囊进入消化道，并快速拍摄消化管道的影像，影像可以传输到记录仪器上。此时可通过电脑观察图像进行分析，以判断有无异常、异常部位及具体情况。由于胶囊内镜不存在活检通道，因此不能够做活检，只能够进行观察。但对于观察结果而言，胶囊内镜与电子胃肠镜的准确程度相似。
进行不插管胃肠镜检查的前一天要注意忌烟酒，尽量避免吃不容易消化的食物，不要吃辛辣、刺激性的食物。在检查前一天的晚餐应该吃易消化的软食，在检查前需注意禁食。此外在检查前一天晚上不要饮用有色饮料，也不能吃有色药品，以免影响检查判断。