儿童神经系统疾病有很多，主要包括遗传代谢性神经疾病、先天性神经病变、中枢神经感染性疾病、神经系统损伤性疾病、颅内占位性疾病、脑血管病等。
1、遗传代谢性神经疾病：脑白质营养不良、苯丙酮尿症等遗传代谢性神经疾病，患病后可能会影响到儿童的智力；
2、先天性神经病变：末梢神经炎、神经皮肤综合征、脊髓小脑性共济失调等，通常会出现神经发育异常的表现，如感觉障碍、视力障碍；
3、中枢神经感染性疾病：主要包括急性脑炎、急性脊髓炎、脊髓灰质炎、结核性脑膜炎、细菌性脑膜炎、病毒性脑膜炎、化脓性脑膜炎等，临床上表现为高热、喷射性呕吐、剧烈头痛，有可能会出现抽搐、昏迷等表现；
4、神经系统损伤性疾病：最常见缺血缺氧性脑病，由于出生的时候重度窒息，可能导致神经系统损伤，继发导致智力低下，以及出现脑瘫的情况；外伤导致的中枢神经系统损伤性疾病，如颅骨骨折或颅内出血，可能会出现头痛、恶心、视力异常等症状；
5、颅内占位性疾病：脑积水、颅内肿瘤，如胶质瘤、垂体瘤、脑血管瘤、生殖细胞瘤，以及累及颅脑的淋巴瘤等，可能会累及中枢神经系统，通常伴随 恶心、呕吐等症状；
6、脑血管病：脑供血不足、脑梗死、脑血管畸形、脑出血等，可能会出现肢体偏瘫、口角歪斜等症状。
此外儿童神经系统疾病还包括癫痫、脑性瘫痪，还有重症肌无力、进行性肌营养不良、面神经麻痹、运动神经元病、小舞蹈病、肝豆状核变性、烟雾病等。