清宫手术大约需要五分钟左右的时间，在手术过程可能会出现疼痛，如宫颈扩张棒从宫颈外口通过宫颈内口时引起扩张性疼痛，清除宫腔内组织物时，刮匙与子宫壁接触，刺激子宫引起收缩，也会导致疼痛等。此外当女性存在盆腔炎症、宫腔粘连或宫内残留组织物与子宫壁粘连较为严重时，清宫时疼痛会严重一些。疼痛的程度因人而异，对疼痛比较敏感、痛阈比较低的人，会感觉疼痛的程度比较严重，相反则感觉疼痛并不严重。
如果患者对较为疼痛敏感，建议考虑做无痛清宫，无痛清宫需要静脉注射麻药，是在完全没有痛觉的情况下完成手术，手术结束后大约五分钟病人就会清醒。但是需要注意，如果患者存在咳嗽或心功能不好的情况，不适合做无痛清宫。清宫手术之后留院观察一个小时，阴道流血不多，没有下腹部疼痛才可以离开医院，并且术后要加强外阴护理，勤换卫生巾。十天后患者需要到医院复查B超，了解子宫恢复情况以及宫内是否有残留组织物。