如果是普通手卫生，卫生手消毒检查的细菌菌落数≤10cfu/cm2为合格。但是如果是进行手术之前的外科手消毒，要求则更高，外科手消毒检查的细菌菌落数≤5cfu/cm2为合格。
由于人体的手长时间暴露在外界环境中，在日常生活中人的手会直接、频繁地接触物品，手上会残留各种细菌病毒，这些细菌不仅会使自己染上病，还会传染给别人，保持手卫生是预防疾病感染的关键。保持手卫生应做到勤洗手，饭前、便后都要洗手，洗手时要应用肥皂或消毒液洗手，一般普通手卫生细菌菌落数≤10cfu/cm2为合格。
而外科手术时，对手卫生的要求很高，目的是清除手部污染物，将细菌减少到最低，避免术中伤口感染。外科手消毒除了简单的肥皂水冲洗外，还需要再涂抹一遍消毒液，由于消毒液中都含有酒精，消毒效果非常好，可以杀灭手部上面的细菌，此时细菌菌落数≤5cfu/cm2为合格。
常见检查手部菌落总数的方法为采用涂抹法，需请被检人五指并拢，用浸湿稀释液的棉签在右手指曲面，从指尖到指端来回涂擦10次，然后剪去手接触部分棉棒，将棉签放入含10mL灭菌稀释液的采样管内送检。