大三阳转氨酶出现升高，代表肝功能出现损伤，建议由医生根据肝功能转氨酶高升高原因，采取不同的治疗。如果大三阳患者近期大量喝酒或者由药物损伤等，引起转氨酶轻度升高，可以进行单纯的保肝治疗，例如护肝片、益肝灵片、还原型谷胱甘肽等药物治疗，并定期进行复查，动态观察肝功能情况。
但多数患者可能会是由于乙肝病毒引起，需要做乙肝病毒定量监测，并结合抗病毒、保肝药物的治疗。保肝药物的使用，需要根据转氨酶、胆红素升高程度来进行判断，而抗病毒药物是使用核苷类似物和干扰素。干扰素的应用有较严格的适应证，需要看肝功能状态，而核苷类似物的应用指征较宽，不论肝硬化、肝癌造成肝功能的严重状态，核苷类似物都可以应用。核苷类似物主要有恩替卡韦、富马酸替诺福韦二吡呋酯、富马酸丙酚替诺福韦等，这几种药物是作为抗乙肝病毒的核苷类似物的一线药物。任何药物的使用，都应在医生指导下进行。
抗病毒药物往往需要长期应用，因为病毒转阴不代表病毒完全清除，在肝细胞内可能存在乙肝病毒，需要长期应用药物控制病毒，防止病情的进展。在进行保肝药物、抗病毒药物的应用时，定期进行肝功能 以及乙肝五项的检查，来判断药物应用的效果。