南京比较好的鼻科医院包括南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等。其中，南京医科大学第一附属医院耳鼻喉科在耳鼻咽喉-头颈外科领域医疗、教学和科研方面取得了长足的发展。该科是南京医科大学耳鼻咽喉科学博士学位和硕士学位授权点，江苏省耳鼻咽喉科医疗质量控制中心挂靠单位，江苏省临床重点专科，江苏省135工程医学重点学科，江苏省科教兴卫工程医学重点学科，也是国家首批住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业基地；南京鼓楼医院耳鼻喉科是全国首批鼻内镜教学培训基地，主要疾病诊疗范围涵盖了慢性鼻窦炎伴或不伴鼻息肉药物和手术治疗，过敏性鼻炎药物和免疫治疗，鼻腔鼻窦良恶性肿瘤手术治疗，晚期鼻咽癌手术治疗等，对于鼻科疾病有较为丰富的治疗经验；东南大学附属中大医院耳鼻喉科具有先进的医疗设备，擅长鼻内窥镜手术（鼻息肉、鼻窦炎、鼻窦囊肿及鼻窦真菌病等）及其手术延伸如鼻内窥镜下脑脊液鼻漏修补术、鼻腔泪囊造口术治疗慢性泪囊炎（面部不留疤痕）、眶减压术及鼻鼻窦肿瘤切除等。