安徽省公立医院排名靠前的有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院等。安徽医科大学第一附属医院是集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的大型综合性教学医院，为国家卫生应急医疗移动救治中心和安徽省紧急医疗救治基地，为卫生部首批三级甲等医院，连续12年入围中国最佳医院百强榜，复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》排名75，银屑病的遗传学研究和红斑狼疮基因研究处于国际领先水平。 安徽省立医院为一所设备先进、专科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的省级大型三级甲等综合性医院，连续五年进入复旦版《中国医院综合排行榜》全国百强，形成了以器官移植、心脑血管疾病为代表的疑难重症救治技术，以介入、腔镜为代表的微创技术，入选2项国家疑难病症诊治能力提升工程项目（脑血管和肿瘤方向），目前是全国为数不多、安徽省唯一一家拥有心脏、肺脏、肝脏、肾脏、胰腺、小肠、角膜等全部器官（组织）移植资质的医院。 其他较好的三甲医院有蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院、安徽医科大学第二附属医院、合肥市第一人民医院等。