乌鲁木齐的新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院的肛门科室好。 新疆维吾尔自治区人民医院肛肠外科的诊疗水平全疆领先，学科诊治病种涵盖结直肠疾病（直肠癌、直肠炎、肛门直肠神经官能症、直肠息肉、脱肛、直肠前突等）、盆底疾病（便秘、盆底下降、盆底松弛、盆底痛、盆腔脏器脱垂等）、肛周疾病（各类痔病、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、肛乳头瘤、肛隐窝炎、肛门狭窄等）。 新疆医科大学第一附属医院肛肠科是一所集医疗、教学、科研为一体的大型三级甲等医院。以肛肠疾病诊治为重点，以微创手术为特色，以开拓创新为动力，开展了微创手术治疗内、外痔、混合痔、肛裂、肛门狭窄、肛周脓肿、肛瘘、直肠脱垂、肛周湿疹、藏毛窦等疾病。 新疆医科大学第二附属医院普外科是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。熟悉普外科及肛肠常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗各种外伤、脏器破裂、直肠肿物、痔疮等方面具有显著优势。