长宁区的三甲医院有很多，但是并没有绝对的医院排名，相对较好的医院有武警上海总队医院、中国人民解放军海军特色医学中心、中国人民解放军海军第九〇五医院等。 武警上海总队医院中的腹腔镜手术、烧伤救治、血液净化、妇科、不孕症治疗以及泌尿、肛肠、准分子激光、超声乳化等特色专科在上海地区有广泛影响。 中国人民解放军海军特色医学中心主要担负海军特殊职业病研究、预防、诊治，应急支援保障，南山场站医院飞行员生理心理保障中心派驻保障，海军招收飞行学员医学选拔鉴定、舰载战斗机飞行员健康鉴定等任务。 中国人民解放军海军第九〇五医院是中国人民解放军三级甲等综合性医院，上海市首批医保定点医院。医院先后被国家卫生部、国家药品监督管理局、国家中医药管理局、总后卫生部联合表彰为抗震救灾医药卫生先进集体，获得全军为部队服务达标先进医院、卫生信息化建设先进单位、上海市文明卫生标兵单位等荣誉。