重庆甲亢医院排名第一的是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院等，可就诊于内分泌科。 陆军军医大学第一附属医院内分泌科在自体骨髓干细胞移植治疗糖尿病足、骨质疏松的诊治、糖尿病及其慢性并发症的诊治、甲状腺疾病的微创治疗、肥胖的诊治、其他内分泌疑难杂症的诊治方面经验丰富。 重庆医科大学附属第一医院内分泌科为卫生部“国家临床重点专科”，是重庆市内分泌领域的唯一的国家级重点专科。2013年成立重庆市内分泌科医疗质量控制中心。科室在糖尿病、垂体/肾上腺疾病、甲状腺疾病、代谢性骨病等诊治和科研处于国内一流水平。 陆军军医大学新桥医院内分泌科是集医疗、教学、科研为一体的内分泌代谢病专科。现已发展成为西部地区临床规模最大的内分泌及代谢性疾病诊治中心之一，对于甲状腺疾病的诊治有丰富的临床经验。