温州比较好的肛肠科有温州医科大学附属第一医院、温州医科大学附属第二医院、温州市人民医院等。 温州医科大学附属第一医院结直肠肛门外科建立了温州医科大学结直肠癌临床研究中心和国家级GCP药物临床试验基地。其诊疗范围及特色包括低位及超低位直肠癌保肛、直肠癌保肛与功能康复、结直肠肛门良性疾病与结直肠肛门恶性肿瘤的并重发展等。 温州医科大学附属第二医院中西医肛肠科为浙江省中医药重点学科，浙江省中医药重点名科，温州市中西医结合结直肠肛门病诊治中心，是温州市医学会肛肠外科委员会、温州市中西医结合学会肛肠专业委员会和温州市中医药学会肛肠专业委员会主任委员单位，国家药物临床试验基地。 温州市人民医院结直肠肛门外科为临床一级学科，承担结直肠肿瘤的诊断及治疗工作，如大肠息肉、大肠息肉病、大肠良恶性肿瘤等；各种肛门部疾病的诊断及治疗，如肛瘘、肛裂、内痔、外痔、肛周脓肿、直肠脱垂等；各种原因引起的排便异常（便秘、大便失禁等）及盆底疾病的诊治；肛门直肠外伤的诊治；各种原因引起的结、直肠瘘的诊治工作。