南京治疗前列腺炎比较好的医院是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等。 其中南京医科大学第一附属医院是江苏省属三级甲等综合性医院，泌尿科已发展成为集医疗、教学、科研于一体，学科规模、专科设备、技术水平国内一流的现代化学科，在前列腺炎、前列腺增生等方面经验丰富。 南京鼓楼医院的泌尿外科是江苏省医学重点学科、江苏省临床重点专科、南京市医学重点学科，是国家卫计委授权的达芬奇手术机器人中国泌尿外科临床手术教学示范中心，擅长泌尿外科常见病的治疗，如前列腺炎、前列腺肿瘤等。 东南大学附属中大医院泌尿外科，现为“江苏省省级临床重点专科”、“江苏省科教强卫工程医学创新团队”。科室致力于泌尿系疑难病症的诊治，先后开展了根治性全膀胱切除术及各类尿流改道手术、根治性前列腺切除术、巨大肾癌及腹膜后肿瘤手术等泌尿外科疑难手术，并积累了大量临床经验。