口腔黏膜科比较好的医院有北京大学口腔医院、四川大学华西口腔医院、上海交通大学医学院附属第九人民医院等。这三家医院的口腔黏膜科分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第1、2、3名。 北京大学口腔医院口腔黏膜科在国内率先开展口腔黏膜病的临床诊治工作和教学工作，尝试采用中西医结合的方法诊治口腔黏膜疾病，目前科室在口腔黏膜疑难病诊治及口腔中西医结合方面在全国享有盛誉。 四川大学华西口腔医院口腔黏膜病科是全国历史最悠久、规模最大的口腔黏膜病综合诊疗中心之一，是国家级临床重点专科。科室技术力量雄厚，学术梯队合理，对常见口腔黏膜病（如口腔扁平苔藓、口腔白斑病、各类口腔溃疡、口腔黏膜特殊感染、口腔黏膜大疱类疾病、灼口综合征、唇舌疾病等）以及各类疑难杂症的诊疗水平达国内一流。 上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔黏膜病科为我国最早建立的、以研究和治疗口腔黏膜疾病为主的单位之一，在口腔白斑、口腔扁平苔藓等癌前病变的中西医结合治疗，分子标志物的筛选和开发具有癌化学预防作用的中成药等方面取得了一定的成果。在唇部疾病和斑纹类疾病的临床研究和疗效方面居全国领先地位，并在国际上有一定的声誉。