南京医院耳鼻喉科好的有南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等。 其中南京医科大学第一附属医院耳鼻喉科是国家首批住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业基地，在耳鼻咽喉-头颈外科领域医疗、教学和科研方面取得了长足的发展，2021年耳鼻咽喉科护理组荣获共青团中央和国家卫生健康委颁授的第20届全国青年文明号荣誉称号。 南京鼓楼医院耳鼻咽喉科设有耳鼻咽喉内镜中心、临床听力检测中心、耳鸣和前庭功能诊疗中心和基础实验室。历经几代人的共同努力，目前是国家残联和省残联人工耳蜗捐赠项目指定完成单位（省内唯一）、江苏省科教强卫医学重点学科、江苏省临床重点专科、南京市重点学科，全国首批鼻内镜和咽喉内镜教学培训基地。 东南大学附属中大医院耳鼻咽喉科经过几十年来不断发展壮大，已成为学术梯队健全技术力量雄厚的科室。近年来大力开展的新技术、新疗法紧跟国际、国内耳鼻咽喉-头颈外科发展步伐。