咸宁三甲医院主要有咸宁市中心医院、咸宁市中医医院，其中咸宁市中心医院创建于1966年，是鄂南地区唯一的一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体，医疗技术力量雄厚，综合实力最强，规模最大的国家级综合性三级甲等医院，设有38个临床科室，7个医技科室。目前拥有9个省级临床重点专科（消化内科、普通外科、神经外科、产科、儿科、眼科、输血科、临床药学和病理科），2个省级重点建设专科（新生儿科、肿瘤科），35个市级重点专科。 咸宁市市中医医院创建于1981年9月，是一所集医疗、科研、教学、康复、预防于一体，中医药为主、中西医结合的三级甲等中医医院，现设有脑病科、肺病科、重症医学科、急诊科、内科、外科、妇产科、儿科等一级临床学科（科室）26个，设有康复科、脑病科、老年病科等三个省级重点专科，骨伤科、肛肠科等五个市级重点专科。