重庆甲状腺手术好的医院有陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、重庆大坪医院等。 陆军军医大学第一附属医院普外科在治疗甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、甲状腺炎、甲状腺结节、甲状腺囊肿、甲状腺腺瘤、甲状腺肿瘤、结节性甲状腺肿等方面具有显著优势。 重庆医科大学附属第一医院乳腺甲状腺外科是西南地区甲状腺疾病临床研究的主要基地之一，技术水平处国内前列，是本地区拥有最多病例数的医疗机构之一。开展了大量被友邻省市医院认为无法治疗的巨大、晚期、难治性甲状腺癌的手术治疗，并取得满意疗效。近年成功开展的内镜辅助下甲状腺肿瘤切除术（微创手术），可经乳晕、腋窝、口腔途径，既达到甲状腺肿瘤的治疗目的，又达到颈部无痕的美观要求。 重庆大坪医院乳腺甲状腺外科集医、教、研为一体的国家重点学科，博士学位授予单位，重庆市乳腺肿瘤早期诊断和微创手术示范中心，重庆市青年文明号单位。科室拥有先进乳腺甲状腺外科相关医疗设备，如甲状腺术中神经监测仪、乳腺前哨淋巴结活检系统等，在治疗甲状腺疾病有着丰富的经验。