北京大兴区医院排行榜靠前的有首都医科大学附属北京同仁医院亦庄院区、中国中医科学院广安门医院南区、首都医科大学附属北京口腔医院（西红门部）等。 首都医科大学附属北京同仁医院亦庄院区是一所以眼科学、耳鼻咽喉科学为国家重点学科的大型综合三甲医院，是全国防盲技术指导组和防聋治聋技术指导组组长单位，设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心。 中国中医科学院广安门医院南区是大兴区唯一一所集医、教、研、社区健康服务为一体的综合三甲中医医院，是全国中医医院中医文化建设重点建设单位，依托院本部资源优势，该院采用中医、中西医结合综合治疗，为患者提供优质医疗服务。 首都医科大学附属北京口腔医院（西红门部）的口腔显微诊疗中心是北京口腔医院一址多点布局下的第一个口腔综合门诊部，专业涵盖牙体牙髓、牙周病、儿童口腔、口腔牙槽外科及种植、修复、正畸等，实现优质医疗资源下沉，能满足市民口腔常见疾病诊疗需求。