甲状腺癌的发病不仅是检出率的增高，发病率也确实存在增高的趋势。目前原因还未得到完整的解释，现在医学界探讨下面几个方向：
1、精神压力、社会压力，还有生活环境；
2、家族史，家族里有甲状腺癌的患病史；
3、幼年时期的放射线照射史；
4、食用含碘丰富饮食，会对甲状腺造成过多刺激。但是现在有关研究机构做出的结论，甲状腺癌患者尿碘含量也并不比正常人要高，高碘是甲状腺癌的危险因素这个命题也还未成立。
5、从基因的角度研究，最常见BRAF基因突变以后可以出现甲状腺癌的发生。现有的证据认为，部分甲状腺癌的患者可以发现BRAF基因突变，基因的研究也可能是将来的突破。
目前对于甲状腺癌的发病原因还未清晰，所能够做到的就是早期检出，除特殊的患者以外，多数的患者还都是需要进行积极的手术治疗。