肛门有分泌物的原因较复杂，可能由肛瘘、肛周皮炎、肛门控便功能下降等原因导致，具体如下：
1、肛瘘：为导致肛门出现分泌物的常见原因，肛门旁存在外口，反复有脓血性或黄色分泌物从外口流出；
2、肛门控便功能下降：肛门控便功能下降后，对气体、液体的控制能力下降，可能部分液体便从肛门非自主排出，造成分泌物的存在；
3、肛周皮炎：接触性皮炎或急性湿疹都可能使皮肤创面出现渗出，导致肛门有分泌物存在；
4、感染因素：部分患者可能出现肛门局部的感染状态，如肛门脓肿。肛门脓肿发展到一定程度后，随其软化、破溃，有脓血性液体流出。
对于肛门分泌物，需结合其症状做鉴别诊断。部分患者有分泌物存在，但没有找到具体病因，则需一定时间观察。