小儿脓肿血症属于严重的感染，若抗生素使用得当，通常在发病后1个月左右，小儿的机体免疫力可以逐渐恢复。但部分患儿的身体较差或感染较严重，且使用抗生素的效果较差，可能会危及生命。小儿脓肿血症的恢复时间是比较复杂的问题，与控制感染程度、机体状况、感染细菌毒力、使用抗生素强度、细菌耐药性有关。
当患儿出现脓毒血症后，需要及时治疗，建议使用强有力的抗生素进行积极的抗感染治疗，直至完全控制住细菌后，病情即可好转。对于身体较差、原发病较严重，比如具有免疫力缺陷的患儿，或存在血液病的患儿在化疗过程中并发脓毒血症，此时的预后较差，虽然经过相应治疗，但无法控制感染，并且会危及生命。