角膜炎长期不好主要原因是没有明确病因，因为角膜炎由很多病因引起，如果没有找到明确原因，则很难及时得到治疗。即使已经找到明确病因，部分角膜炎也不容易痊愈或者短时间内痊愈，比如与神经损伤或者免疫相关的角膜炎。此外部分老年人的抵抗力下降，或者有其他的全身疾病，比如糖尿病、类风湿等，与全身疾病相关的角膜炎，治疗也比较棘手。
如果患角膜炎关键要明确病因，针对病因进行治疗，明确病因后要定期到眼科进行复查。部分角膜炎患者可能需要通过手术治疗，防止病情进一步恶化，比如眼膜覆盖、板层角膜移植、治疗性角膜移植。所以出现角膜炎后不要掉以轻心，一定要到医院进行及时检查，明确病因后采用最佳的治疗手段。