肠镜下取活检的情况，主要如下：
1、如果发现息肉，通常均需取活检；
2、如果发现局灶炎症反应，存在黏膜粗糙也需活检；
3、如果还有特殊病变，如增生量的改变、黏膜的血管、腺管异常等。若到达回盲瓣时，即小肠和结肠交界处，表面有糜烂、充血、溃疡等要活检。若进入到小肠末端即回肠末端时，出现淋巴滤泡的增生、炎症反应、溃疡白苔等也会取活检；
4、肠道病变，既往有结肠病病史患者，如溃疡性结肠炎、克罗恩病、伪膜性肠炎等也会活检。有肠病、便血者，在肠道内只看到部分糜烂，无明确的占位性病变时，会按部位取活检确诊有无缺血性肠病，若在显微镜下能看到黏膜小血栓，可进一步诊断。