如果是持续性房颤，房颤患者栓塞的可能性非常高，这时需要预防栓塞，需要用抗凝药物，例如华法林或者新型抗凝药，如达比加群和利伐沙班。
应用华法林的时候需要监测凝血功能中INR的指标，抽血的次数比较频繁，根据INR的指标调整华法林的用量，有的病人因为不愿意反复的抽血造成华法林应用的不是很普遍，尤其是瓣膜病合并房颤的病人必须应用华法林。
而新型抗凝药物达比加群和利伐沙班不需要反复抽血，需要定期复查凝血功能。但是瓣膜病合并房颤的病人不能用新型抗凝药，新型抗凝药价格昂贵，会造成经济困难的病人的经济负担加重。