第一个区别，是他们的解剖部位不同，我们的心脏是一个中空的肌性器官，可以把它简单的想象成一个二层的房子。一楼是左右心室相互比邻，二楼是左右心房相互比邻，心室之间的缺损就叫室缺，心房之间的缺损叫房缺。
第二个区别，是他们的后果严重程度不一样，一般室缺的后果比较严重，他的杂音比较响，对心脏影响比较大，对孩子生长发育影响也比较大。表现为生长发育的迟缓，经常感冒或者运动耐力的不足，而房缺除非是巨大房缺，一般不影响生长发育，孩子也不容易生病，心脏变形也不太严重。在过去的年代，好多人在不知道房缺的情况下，妇女正常生育了很多的孩子，并且也活到正常人的寿命，老了以后可能会有一些心功能的问题。
第三个区别，就是他们对治疗的要求也不一样，室缺那肯定是要求是积极的治疗。房缺如果特别小也可以观察，如果超过五毫米也是主张要进行封堵的。现在总体来说治疗还是相对比较发达的，可以通过微创的手术进行治疗。