部分药物需在饭前服用，如抑制胃酸的质子泵抑制剂，这类药物通常需饭前0.5-1小时服用，才可最大限度的发挥作用。一些药物像硫糖铝、胶体果胶铋，需在胃酸的作用下才能变成黏稠的液体，该部分黏膜保护剂一定要在饭前空腹时服用。而部分药物帮助消化，需与食物一起服用，包括米曲菌胰酶片、复方阿嗪米特肠溶片。部分药物需在饭后服用，如用于治疗胃病的中药、中成药，为减少中成药对胃黏膜的刺激，可以将这些药放在饭后服用，多数建议在饭后15分钟左右服用为佳。
服药时最好用白开水送服，尽量不要与牛奶、茶水、饮料同服，以免产生不良反应。在用药期间禁止饮酒，在服药前还要注意观察药物是否在有效期内。