核磁共振MRI检查根据场强的不同会有不同的机器检查，效果也会有所不同，常见的有0.35T、1.0T、1.5T和3.0 T，T是“特斯拉”的简称，是磁场强度的单位。低场强核磁共振机器可用永磁做成开放式，作为高场强磁共振3.0 T相对1.5 T有更多优势，比如信噪比更高、空间分辨率更高、图像质量更好、扫描速度更快、增强效果更好、对脑内微出血检出率更高，在关节成像、腹盆腔脏器成像及CeMRA比1.5好。而且3.0可以做很多功能成像，如灌注ASL和弥散成像DWI（对早期脑缺血特别是缺血半暗带的显示更好），还有波谱成像MRS（对肿瘤的鉴别诊断有很大意义），磁敏感成像SWAN。
但同时也会有些劣势，比如金属伪影更明显，因此对有金属异物的患者限制更严格，磁敏感伪影更明显、骨组织与软组织交界面伪影更大、化学位移的伪影更大、脂肪组织交界面伪影更大。肥胖患者、腹水患者、孕妇等大腹围的患者产生的伪影会更大，影响诊断，运动伪影较难控制、性价比低，MRA、MRM、嵴柱成像相对较差等。另外，还有组织产热更多，因此患者会觉得身体发热更明显。
有经验的医生会根据病人的病史、病情做出相应的判断，该不该做，什么时候做，医生们会首选最利于病变显示、最利于病人配合、对病人影响最小的一种检查方法来帮助诊疗。