艾滋病毒感染人体之后,如果到达艾滋病期,叫做获得性免疫缺陷综合征,就是人的免疫系统有缺陷,所以艾滋病毒侵犯的是人体免疫系统。免疫系统可以分为很多个组成部分,包括淋巴细胞、白细胞等等,艾滋病毒主要侵犯T淋巴细胞中的一部分,包括CD4+T淋巴细胞,可以作为艾滋病毒的主要存储库。当进行抗病毒治疗的时候,艾滋病毒的复制被抑制,但是在这些细胞之中的艾滋病毒不会被完全清除,仍然能够存储起来,当相应的抗病毒治疗停止之后,病毒仍然能够再活跃,然后复制出比较多的艾滋病毒量。被感染的CD4+T淋巴细胞的计数,可能会因为艾滋病毒感染逐渐下降,经过无症状期的6-8年,CD4+T淋巴细胞计数就会下降。如果下降到了200个/μL以下,各种条件致病菌就能够导致感染,引起临床症状,进入艾滋病期。

