分离性身份障碍的治疗包括心理治疗和药物治疗。治疗原则是心理治疗为主，对于伴有其他精神症状者可对症选用药物治疗。心理治疗方法主要包括认知治疗、催眠治疗和家庭治疗，一般进行心理治疗需要持续3~6年。
一、药物治疗
1、抗抑郁药物：如氟西汀、艾司西酞普兰、舍曲林等常用抗抑郁药物，有减轻抑郁和稳定情绪的作用。适用于共病抑郁障碍的患者，对抗抑郁药物不能耐受者慎用。
2、苯二氮䓬类药物：常用的有劳拉西泮、氯硝西泮、地西泮，可以减少焦虑、侵入性症状和警觉性增高症状。适用于伴有焦虑障碍或创伤后应激障碍者，伴有药物成瘾者慎用。
3、抗精神病药物：非典型抗精神病药物如利培酮、喹硫平、齐拉西酮、奥氮平等对于分离性身份障碍患者的过度焦虑和侵人性症状可能比典型的抗精神病药更有效和有更好的耐受性。氯氮平可能对长期患有分离性身份障碍的患者有效，对抗精神病药物副作用不能耐受者慎用。
二、手术治疗
本病无需手术治疗。
三、心理治疗
1、认知治疗：许多具有分离性身份障碍的患者有认知障碍，他们对认知治疗反应较慢，成功的认知干预应该是帮助他们逐渐认识到分离的部分，并逐渐整合，相反改变太快可能导致患者的烦操不安。这些患者需要长期的治疗，并同时关注他们的症状控制和整体生活功能的提高。
2、催眠治疗：在催眠开始时首先要对患者进行分离性身份障碍知识和催眠知识的教育，对催眠过程中可能产生的心理冲突外显化给予充分告知，让患者有充分的心理准备，必要时获得患者书面的知情同意。催眠用来营造轻松的精神状态，可以在不太焦虑状态下讨论消极的生活事件，减轻症状，去除隔离他们情感和记忆的心理屏障。
3、家庭治疗：在有分离性身份障碍患者的家庭中，家庭或夫妻治疗对稳定家庭关系和处理常见症状很重要。家庭教育并关注分离性身份障碍患者，可以帮助家庭成员更有效地应对患者的分离性身份障碍和伴随的创伤后应激障碍的症状，对家庭成员进行集体教育和支持也是有益的。性治疗是夫妻治疗的重要组成部分，因为分离性身份障碍的患者可能会在一段时间内对亲密接触产生强烈的恐惧，帮助配偶以一种有益的方式来处理这一问题可能减少恐惧，增进关系。
一、药物治疗
1、抗抑郁药物：如氟西汀、艾司西酞普兰、舍曲林等常用抗抑郁药物，有减轻抑郁和稳定情绪的作用。适用于共病抑郁障碍的患者，对抗抑郁药物不能耐受者慎用。
2、苯二氮䓬类药物：常用的有劳拉西泮、氯硝西泮、地西泮，可以减少焦虑、侵入性症状和警觉性增高症状。适用于伴有焦虑障碍或创伤后应激障碍者，伴有药物成瘾者慎用。
3、抗精神病药物：非典型抗精神病药物如利培酮、喹硫平、齐拉西酮、奥氮平等对于分离性身份障碍患者的过度焦虑和侵人性症状可能比典型的抗精神病药更有效和有更好的耐受性。氯氮平可能对长期患有分离性身份障碍的患者有效，对抗精神病药物副作用不能耐受者慎用。
二、手术治疗
本病无需手术治疗。
三、心理治疗
1、认知治疗：许多具有分离性身份障碍的患者有认知障碍，他们对认知治疗反应较慢，成功的认知干预应该是帮助他们逐渐认识到分离的部分，并逐渐整合，相反改变太快可能导致患者的烦操不安。这些患者需要长期的治疗，并同时关注他们的症状控制和整体生活功能的提高。
2、催眠治疗：在催眠开始时首先要对患者进行分离性身份障碍知识和催眠知识的教育，对催眠过程中可能产生的心理冲突外显化给予充分告知，让患者有充分的心理准备，必要时获得患者书面的知情同意。催眠用来营造轻松的精神状态，可以在不太焦虑状态下讨论消极的生活事件，减轻症状，去除隔离他们情感和记忆的心理屏障。
3、家庭治疗：在有分离性身份障碍患者的家庭中，家庭或夫妻治疗对稳定家庭关系和处理常见症状很重要。家庭教育并关注分离性身份障碍患者，可以帮助家庭成员更有效地应对患者的分离性身份障碍和伴随的创伤后应激障碍的症状，对家庭成员进行集体教育和支持也是有益的。性治疗是夫妻治疗的重要组成部分，因为分离性身份障碍的患者可能会在一段时间内对亲密接触产生强烈的恐惧，帮助配偶以一种有益的方式来处理这一问题可能减少恐惧，增进关系。