目前常见的致病性衣原体，主要是肺炎衣原体和沙眼衣原体，临床上常根据感染衣原体类型，和感染部位的不同，采取以药为主的综合治疗方式，衣原体感染导致的疾病和治疗方法常见有以下几种：
一、肺炎衣原体导致的疾病及治疗方法：
呼吸系统感染，一线治疗药物是四环素、多西环素、红霉素、阿奇霉素和克拉霉素。
二、沙眼衣原体导致的疾病及治疗方法：
1、沙眼：可局部应用15%的磺胺醋酰钠滴眼液或红霉素软膏，急性期或严重的沙眼需要进行全身抗生素治疗，口服多西环素或红霉素；
2、包涵体性结膜炎：局部使用15%的磺胺醋酰钠滴眼液，全身用药方面，婴幼儿和成人均可选用红霉素，成人也可口服多西环素；
3、泌尿生殖系统感染：推荐使用阿奇霉素或多西环素；
4、性病淋巴肉芽肿：可用多西环素、米诺环素、四环素或红霉素。
需要注意的是以上药物必须在医生指导下应用，不可自行擅自用药。
一、肺炎衣原体导致的疾病及治疗方法：
呼吸系统感染，一线治疗药物是四环素、多西环素、红霉素、阿奇霉素和克拉霉素。
二、沙眼衣原体导致的疾病及治疗方法：
1、沙眼：可局部应用15%的磺胺醋酰钠滴眼液或红霉素软膏，急性期或严重的沙眼需要进行全身抗生素治疗，口服多西环素或红霉素；
2、包涵体性结膜炎：局部使用15%的磺胺醋酰钠滴眼液，全身用药方面，婴幼儿和成人均可选用红霉素，成人也可口服多西环素；
3、泌尿生殖系统感染：推荐使用阿奇霉素或多西环素；
4、性病淋巴肉芽肿：可用多西环素、米诺环素、四环素或红霉素。
需要注意的是以上药物必须在医生指导下应用，不可自行擅自用药。