大于八周以上的咳嗽称为慢性咳嗽，不同病因导致的慢性咳嗽治疗方法不一样。有明确病因的慢性咳嗽，包括肺炎、肺结核、肺癌、慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张等。无明确病因的慢性咳嗽，包括咳嗽变异性哮喘、上气道咳嗽综合征、嗜酸性粒细胞性支气管炎、胃食道反流性咳嗽、变应性咳嗽、心理性咳嗽等。针对于感染性咳嗽，比如肺炎、肺结核、支气管内膜结核，可以给予积极的抗感染、抗结核治疗。对于咳嗽变异性哮喘和变应性咳嗽，可以给予止咳平喘治疗，如阿斯美、顺尔宁、信必可都保吸入剂等药物。
对于胃食道反流性咳嗽可以给予抑酸剂、胃肠动力药，以及阿斯美等药物口服。有些疾病导致的咳嗽，如肺炎、肺结核、支气管内膜结核是能够根治的疾病，对于肺癌、慢性阻塞性肺疾病、咳嗽变异性哮喘、上气道咳嗽综合征、变应性咳嗽等是不能够治愈的疾病，所以不能根治咳嗽，但是可以控制咳嗽症状，不同的疾病有不同的治疗方法。
对于胃食道反流性咳嗽可以给予抑酸剂、胃肠动力药，以及阿斯美等药物口服。有些疾病导致的咳嗽，如肺炎、肺结核、支气管内膜结核是能够根治的疾病，对于肺癌、慢性阻塞性肺疾病、咳嗽变异性哮喘、上气道咳嗽综合征、变应性咳嗽等是不能够治愈的疾病，所以不能根治咳嗽，但是可以控制咳嗽症状，不同的疾病有不同的治疗方法。