黏液腺囊肿的治疗原则为消除病因，发现后尽早行手术治疗，也可选择药物保守治疗，以及激光治疗等方式。
一、一般治疗
1、去除病因，加强口腔卫生，每日刷牙两次。有口腔健康隐患要及时处理。
2、减少口腔外伤可能，咀嚼食物时要小心，进食不易太快，降低口腔腺体破坏的可能性。
3、改变咬下唇等不良习惯。
二、药物治疗
1、口服用药：囊肿并发感染或用于术前术后预防感染时需要使用抗生素的治疗。
（1）头孢类抗生素：头孢类药物可用于预防感染，如头孢西丁，头孢呋辛钠等。但是食用头孢期间禁止饮酒。
（2）青霉素类：青霉素类药物抗菌谱较广，可针对还未确定病原菌的囊肿并发感染。
2、药物烧灼腐蚀：先用注射器将囊液吸净，向囊腔内注入2%碘酊或三氨醋酸，停留数分钟，再吸出药液，然后注入药液，反复数次，最后吸净药液。目的是破坏腺上皮细胞，使其失去分泌功能。
三、手术治疗
手术切除：1、局部浸润麻醉下。采用梭形切口，在黏膜下钝、锐性分离囊壁，将囊肿、覆盖黏膜及与囊肿相连的周围腺体一并切除。囊肿位于唇红和唇吻缘上者，可采用纵行梭形切口；位于前庭黏膜者，可采用横梭形切口 。
2、反复损伤的黏液腺囊肿可形成瘢痕并与周围组织粘连，不易分离，此时可适当扩大切除范围。直接缝合创面，5～7天拆线。
四、其他治疗
部分患者还可采取液氮冷冻治疗或激光治疗，也具有一定的效果。
一、一般治疗
1、去除病因，加强口腔卫生，每日刷牙两次。有口腔健康隐患要及时处理。
2、减少口腔外伤可能，咀嚼食物时要小心，进食不易太快，降低口腔腺体破坏的可能性。
3、改变咬下唇等不良习惯。
二、药物治疗
1、口服用药：囊肿并发感染或用于术前术后预防感染时需要使用抗生素的治疗。
（1）头孢类抗生素：头孢类药物可用于预防感染，如头孢西丁，头孢呋辛钠等。但是食用头孢期间禁止饮酒。
（2）青霉素类：青霉素类药物抗菌谱较广，可针对还未确定病原菌的囊肿并发感染。
2、药物烧灼腐蚀：先用注射器将囊液吸净，向囊腔内注入2%碘酊或三氨醋酸，停留数分钟，再吸出药液，然后注入药液，反复数次，最后吸净药液。目的是破坏腺上皮细胞，使其失去分泌功能。
三、手术治疗
手术切除：1、局部浸润麻醉下。采用梭形切口，在黏膜下钝、锐性分离囊壁，将囊肿、覆盖黏膜及与囊肿相连的周围腺体一并切除。囊肿位于唇红和唇吻缘上者，可采用纵行梭形切口；位于前庭黏膜者，可采用横梭形切口 。
2、反复损伤的黏液腺囊肿可形成瘢痕并与周围组织粘连，不易分离，此时可适当扩大切除范围。直接缝合创面，5～7天拆线。
四、其他治疗
部分患者还可采取液氮冷冻治疗或激光治疗，也具有一定的效果。