临床上对于传染性单核细胞增多症,主要以抗病毒治疗及对症治疗为主,早期应用更昔洛韦有明确的疗效,阿昔洛韦、干扰素等抗病毒制剂也有一定的治疗作用。抗菌药物仅用于咽或扁桃体继发链球菌感染史,一般采用青霉素剂,避免使用氨苄西林或阿莫西林等,因为可显著增加出现多形性皮疹机会。重型患者,如咽喉严重病变或水肿时,有神经系统并发症,以及心肌溶血性贫血、血小板减少性紫癜等并发症时,应用短疗程的肾上腺皮质激素,可明显地减轻症状。传染性单核细胞增多症预后大多良好,本病具有自限性,多数患者在2-3周左右痊愈,少数患者可迁延数月,还有少数患者病愈后可复发。本病的病死率在1%以下,死因主要是脾破裂、脑膜炎、心肌炎等。先天性免疫缺陷者感染本病后预后较差,病情可迅速恶化,进而导致死亡。