引起宝宝肠炎的病原菌，包括病毒感染和细菌感染，不同的病原微生物感染，病程时间也不同。轮状病毒性肠炎，一般的病程在3-8天，少数孩子病程时间会更长一些。轮状病毒一般发生在六个月道两岁的小婴儿，发病季节大多在秋冬季。
诺如病毒性肠炎属于自限性疾病，症状往往持续12-72个小时，它可以呈现全年散发状态，爆发的高峰期一般多在寒冷季节，从11月到第二年的二月。产毒性细菌引起的肠炎往往发生在夏季，属于自限性疾病，自然病程一般在3-7天。侵袭性细菌感染造成的肠炎，全年都可以发病，多见于夏季，病情比较重，常常伴有高热，甚至可以出现高热惊厥，容易出现严重的中毒症状，甚至感染性休克，病程时间也相对会比较长。
诺如病毒性肠炎属于自限性疾病，症状往往持续12-72个小时，它可以呈现全年散发状态，爆发的高峰期一般多在寒冷季节，从11月到第二年的二月。产毒性细菌引起的肠炎往往发生在夏季，属于自限性疾病，自然病程一般在3-7天。侵袭性细菌感染造成的肠炎，全年都可以发病，多见于夏季，病情比较重，常常伴有高热，甚至可以出现高热惊厥，容易出现严重的中毒症状，甚至感染性休克，病程时间也相对会比较长。