结肠炎艾灸的穴位以大肠募穴、背俞穴、下合穴为主，神阙穴是局部选穴，用灸法既可以温阳散寒、除湿止泻，又可以清热利湿、止泻，这是治疗肠炎泄泻最主要的穴位。
肠炎的病变部位在大肠，因此选择大肠募穴、天枢穴、背俞穴、大肠俞，俞募相配，与大肠下合穴上巨虚合用，调理肠腑而止泻。针对脾病湿盛之病机关键，取脾经合穴，如阴陵泉穴，健脾、化湿、止泻。若湿热证相明显，即为湿热泄泻，可以选择曲池、委中、金津、玉液加十二井穴、十宣穴。
肠炎的病变部位在大肠，因此选择大肠募穴、天枢穴、背俞穴、大肠俞，俞募相配，与大肠下合穴上巨虚合用，调理肠腑而止泻。针对脾病湿盛之病机关键，取脾经合穴，如阴陵泉穴，健脾、化湿、止泻。若湿热证相明显，即为湿热泄泻，可以选择曲池、委中、金津、玉液加十二井穴、十宣穴。