第二代头孢菌素是临床上常用头孢菌素类药物的品种，代表药物包括头孢呋辛、头孢克洛、头孢丙烯、头孢孟多、头孢替安。第二代头孢菌素是进一步提高对β-内酰胺酶的稳定性，并且加强对阴性杆菌的抗菌作用，对酶的稳定性和对阴性杆菌的作用都强于第一代。第二代头孢菌素对于阳性菌，比如阳性球菌，它的抗菌作用是与第一代头孢菌素相似，有些可能略差。
对厌氧菌来说，第二代头孢菌素有些品种也有一定的抗菌作用，比如头孢孟多、头孢替安。还有就是第二代头孢指数，它对铜绿假单胞菌仍然没有抗菌的活性，这个和第一代头孢菌素比较相似。第二代头孢菌素对临床分离的大肠埃希菌、克雷伯菌属、伤寒沙门菌属、痢疾志贺菌属、阴沟肠杆菌科等革兰氏阴性菌，它的敏感性要强。
对于阳性球菌，比如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、溶血性链球菌等这些阳性菌，第二代头孢菌素仍有一定的抗菌活性。第二代头孢菌素可以适用于敏感菌所导致的上呼吸道感染、下呼吸道感染、泌尿生殖系统的感染、皮肤软组织的感染，以及骨关节炎的感染。另外，它也可以用于围手术区的预防或者是治疗用药。总之，第二代头孢菌素在阴性菌和对酶的稳定性方面强于第一代头孢菌素。
对厌氧菌来说，第二代头孢菌素有些品种也有一定的抗菌作用，比如头孢孟多、头孢替安。还有就是第二代头孢指数，它对铜绿假单胞菌仍然没有抗菌的活性，这个和第一代头孢菌素比较相似。第二代头孢菌素对临床分离的大肠埃希菌、克雷伯菌属、伤寒沙门菌属、痢疾志贺菌属、阴沟肠杆菌科等革兰氏阴性菌，它的敏感性要强。
对于阳性球菌，比如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、溶血性链球菌等这些阳性菌，第二代头孢菌素仍有一定的抗菌活性。第二代头孢菌素可以适用于敏感菌所导致的上呼吸道感染、下呼吸道感染、泌尿生殖系统的感染、皮肤软组织的感染，以及骨关节炎的感染。另外，它也可以用于围手术区的预防或者是治疗用药。总之，第二代头孢菌素在阴性菌和对酶的稳定性方面强于第一代头孢菌素。