HLA-B27阴性通常不能排除强直性脊柱炎，在强直性脊柱炎患者当中，90%的患者HLA-B27呈阳性，但也有10%的比例呈阴性。当然，也不能因HLA-B27是阳性就诊断为强直性脊柱炎，要结合患者的临床症状和实验室检验检查结果综合判断。
对于诊断强直性脊柱炎，有它的一些特征，如询问患者是否出现炎性腰背痛，且年龄＜45岁，腰背痛大于三个月，以及是否有夜间疼痛加重，晨起活动后好转的情况，还有是否有指(趾)炎、肌腱端炎，对非甾体抗炎药治疗反应良好。此外，有无强直性脊柱炎的家族史，有无C反应蛋白升高，有无影像学提示的骶髂关节炎等情况进行综合判断。一个疾病是内因和外因的共同结果，不能单凭HLA-B27阳性与否进行诊断。
对于诊断强直性脊柱炎，有它的一些特征，如询问患者是否出现炎性腰背痛，且年龄＜45岁，腰背痛大于三个月，以及是否有夜间疼痛加重，晨起活动后好转的情况，还有是否有指(趾)炎、肌腱端炎，对非甾体抗炎药治疗反应良好。此外，有无强直性脊柱炎的家族史，有无C反应蛋白升高，有无影像学提示的骶髂关节炎等情况进行综合判断。一个疾病是内因和外因的共同结果，不能单凭HLA-B27阳性与否进行诊断。