初次进行肝病方面的检查，或慢性肝病定期复查，一般常规选择B超检查。B超检查可以检测肝脏的大小、形态的变化，综合肝脏回声强弱、血管走行情况来判断是否有肝损害，同时，也可以帮助明确是否有脂肪肝、血管瘤、肝囊肿、肝结节、肝内占位性病变，及肝硬化。如果B超检查可疑有肝硬化，但不能明确，或肝内发现占位性病变、肝内结节样改变，不能分辨病变性质时，或发现血管性病变，一般需要进一步做CT检查。
CT平扫可以帮助明确是否有肝硬化，但如果需要明确占位性病变及结节的性质，或需要明确血管的病变，一般CT平扫很难解决，需要做增强CT检查。如果增强CT仍不能明确占位性病变，或结节的性质，还需要进一步做增强核磁，或肝特异性对比剂的增强核磁来检查。如果增强核磁或肝特异性对比剂的增强核磁，仍不能明确诊断肝内结节或占位性病变，还需要进一步在B超引导下进行穿刺活检，进行病理组织学方面的进一步明确诊断。如果血管病变不能明确，必要时还需要进一步做血管造影来明确。
如果B超发现肝内外胆管扩张，考虑胆总管有阻塞，一般需要进行增强CT，最好选择增强核磁加MRCP进行胆管相关的检查，明确胆管是否有结石、肿瘤，或硬化性胆管炎、IgG4相关硬化性胆管炎等，如果怀疑后两者，还需进一步进行免疫球蛋白、IgG亚型，以及抗体方面的检查。对于一些疑难病例，病因诊断不清楚，腹部CT检查一般为常规检查项目，一定程度上可以帮助辅助诊断。
CT平扫可以帮助明确是否有肝硬化，但如果需要明确占位性病变及结节的性质，或需要明确血管的病变，一般CT平扫很难解决，需要做增强CT检查。如果增强CT仍不能明确占位性病变，或结节的性质，还需要进一步做增强核磁，或肝特异性对比剂的增强核磁来检查。如果增强核磁或肝特异性对比剂的增强核磁，仍不能明确诊断肝内结节或占位性病变，还需要进一步在B超引导下进行穿刺活检，进行病理组织学方面的进一步明确诊断。如果血管病变不能明确，必要时还需要进一步做血管造影来明确。
如果B超发现肝内外胆管扩张，考虑胆总管有阻塞，一般需要进行增强CT，最好选择增强核磁加MRCP进行胆管相关的检查，明确胆管是否有结石、肿瘤，或硬化性胆管炎、IgG4相关硬化性胆管炎等，如果怀疑后两者，还需进一步进行免疫球蛋白、IgG亚型，以及抗体方面的检查。对于一些疑难病例，病因诊断不清楚，腹部CT检查一般为常规检查项目，一定程度上可以帮助辅助诊断。