湿疹是由内外多种因素所诱发的变态反应性皮肤炎症，肛门湿疹可能与局部的清洁卫生不良、潮湿、多汗有关系，也可能与饮食辛辣刺激，平时熬夜、上火等有关，所以治疗肛门湿疹，首先要养成良好的生活习惯，避免辛辣刺激的食物，局部要勤洗，但要避免搔抓、烫洗。肛门湿疹可以外用抗过敏、止痒的糖皮质激素软膏治疗，比如尤卓尔、地奈德等相对柔和的糖皮质激素制剂，都是可以的，也可以使用非激素类的药物，比如他克莫司软膏、吡美莫司软膏治疗，对肛门湿疹也是有效的。
还有一些中成药膏，比如青鹏软膏、苦参凝胶等也可以用来治疗肛门湿疹。如果局部有明显的渗液、水疱，可以先用硼酸液或者是1:5000的高锰酸钾溶液湿敷，待干燥以后再用乳膏制剂。如果肛门湿疹合并有真菌感染，还要加用咪康唑、酮康唑等抗真菌药物联合治疗。瘙痒特别严重的还可以考虑口服抗组胺药物，比如依巴斯汀、氯雷他定等对症止痒。
还有一些中成药膏，比如青鹏软膏、苦参凝胶等也可以用来治疗肛门湿疹。如果局部有明显的渗液、水疱，可以先用硼酸液或者是1:5000的高锰酸钾溶液湿敷，待干燥以后再用乳膏制剂。如果肛门湿疹合并有真菌感染，还要加用咪康唑、酮康唑等抗真菌药物联合治疗。瘙痒特别严重的还可以考虑口服抗组胺药物，比如依巴斯汀、氯雷他定等对症止痒。