小肠吸收不良综合征的主要病因为小肠黏膜病变，肠道感染、细菌过度繁殖和小肠腔内食糜未完全消化和水解，药物与全身性疾病。药物及手术容易诱发小肠吸收不良综合征。
一、主要病因
1、小肠黏膜病变：各种营养物质的吸收主要在小肠进行，故小肠黏膜病变是造成吸收不良的重要原因。
（1）小肠黏膜有某种先天缺陷与异常，如热带口炎性腹泻、幼儿乳糜泻和非热带口炎性腹泻、乳糖酶缺乏症、葡萄糖-半乳糖吸收不良、无β-脂蛋白血症。
（2）小肠黏膜广泛性病变，如小肠结核、克隆病、多发性憩室炎、嗜酸细胞侵润性胃肠炎、发射小肠炎、小肠缺血及淀粉样变等，其机理主要是小肠绒毛受损害所致；小肠黏膜吸收面积减少，如短肠综合症、淋巴管病变等，当小肠淋巴管发生阻塞或淤滞，淋巴液引流不畅时，可影响脂肪酸、甘油的吸收与运输，从而导致脂肪泻。
2、肠道感染：细菌过度繁殖和小肠腔内食糜未完全消化和水解，可使肠黏膜生广泛性炎症和损伤而导致吸收不良，胆盐缺乏能影响脂肪的乳化，造成脂肪消化不全，乳糜微粒形成障碍易导致吸收不良，要见于严重的肝脏病变、长期肝内外胆管梗阻、回肠切除术后等。
3、药物与全身性疾病：新霉素、消胆胺、氢氧化铝、口服避孕药、对氨基水杨酸、抗癌药、降糖灵、酚酞等药物，有时可引起消化不良。糖尿病、甲状腺机能亢进、阿狄森病、甲状旁腺功能减退症、缩窄性心包炎、充血性心力衰竭、结节性多动脉炎、硬皮病、系统性红斑狼疮，均可导致吸收不良，其机理迄今尚未完全阐明。
4、其他：胃泌素瘤可因肠内的高酸度环境而抑制脂肪酶的活性，导致脂肪吸收不良；小肠假性梗阻、原发性小肠运动过缓等，可使小肠动力障碍而引起吸收不良。
二、诱发因素
1、药物：长期应用广谱抗生素、大量应用免疫抑制剂以及激素等，容易引起消化不良。
2、手术因素：胃大部分切除术后，容易引起食物消化不良，从而导致小肠吸收不良。
3、精神心理因素：情绪低落或抑郁状态时也易诱发小肠吸收不良综合征。
一、主要病因
1、小肠黏膜病变：各种营养物质的吸收主要在小肠进行，故小肠黏膜病变是造成吸收不良的重要原因。
（1）小肠黏膜有某种先天缺陷与异常，如热带口炎性腹泻、幼儿乳糜泻和非热带口炎性腹泻、乳糖酶缺乏症、葡萄糖-半乳糖吸收不良、无β-脂蛋白血症。
（2）小肠黏膜广泛性病变，如小肠结核、克隆病、多发性憩室炎、嗜酸细胞侵润性胃肠炎、发射小肠炎、小肠缺血及淀粉样变等，其机理主要是小肠绒毛受损害所致；小肠黏膜吸收面积减少，如短肠综合症、淋巴管病变等，当小肠淋巴管发生阻塞或淤滞，淋巴液引流不畅时，可影响脂肪酸、甘油的吸收与运输，从而导致脂肪泻。
2、肠道感染：细菌过度繁殖和小肠腔内食糜未完全消化和水解，可使肠黏膜生广泛性炎症和损伤而导致吸收不良，胆盐缺乏能影响脂肪的乳化，造成脂肪消化不全，乳糜微粒形成障碍易导致吸收不良，要见于严重的肝脏病变、长期肝内外胆管梗阻、回肠切除术后等。
3、药物与全身性疾病：新霉素、消胆胺、氢氧化铝、口服避孕药、对氨基水杨酸、抗癌药、降糖灵、酚酞等药物，有时可引起消化不良。糖尿病、甲状腺机能亢进、阿狄森病、甲状旁腺功能减退症、缩窄性心包炎、充血性心力衰竭、结节性多动脉炎、硬皮病、系统性红斑狼疮，均可导致吸收不良，其机理迄今尚未完全阐明。
4、其他：胃泌素瘤可因肠内的高酸度环境而抑制脂肪酶的活性，导致脂肪吸收不良；小肠假性梗阻、原发性小肠运动过缓等，可使小肠动力障碍而引起吸收不良。
二、诱发因素
1、药物：长期应用广谱抗生素、大量应用免疫抑制剂以及激素等，容易引起消化不良。
2、手术因素：胃大部分切除术后，容易引起食物消化不良，从而导致小肠吸收不良。
3、精神心理因素：情绪低落或抑郁状态时也易诱发小肠吸收不良综合征。