非细菌性前列腺炎目前分类叫做Ⅲ型前列腺炎，又细分为ⅢA型和ⅢB型。ⅢA型前列腺炎都先经验性进行抗生素治疗，可以采用左氧氟沙星、阿奇霉素、头孢地尼、头孢克肟等广谱抗生素。如果治疗有效果，继续可以使用一个月以上。
如果没有明显效果，推荐应用ⅢB型的治疗方案。ⅢB型通常不使用抗生素治疗，首选的药物是α受体阻滞剂，能够明显缓解下尿路症状，比如多沙唑嗪、坦索罗辛、赛洛多辛、特拉唑嗪等。植物制剂也是推荐使用品种，比如普适泰、锯叶棕果实提取物等。如果症状明显，可以配合使用非甾体抗炎镇痛药，比如布洛芬，还可以选择的药物有M受体阻滞剂，比如索利那新、托特罗定，还有中草药或者是中成药，比如前列舒通胶囊、癃清片等等，部分有焦虑抑郁的患者还可以使用抗焦虑和抗抑郁的药物。
如果没有明显效果，推荐应用ⅢB型的治疗方案。ⅢB型通常不使用抗生素治疗，首选的药物是α受体阻滞剂，能够明显缓解下尿路症状，比如多沙唑嗪、坦索罗辛、赛洛多辛、特拉唑嗪等。植物制剂也是推荐使用品种，比如普适泰、锯叶棕果实提取物等。如果症状明显，可以配合使用非甾体抗炎镇痛药，比如布洛芬，还可以选择的药物有M受体阻滞剂，比如索利那新、托特罗定，还有中草药或者是中成药，比如前列舒通胶囊、癃清片等等，部分有焦虑抑郁的患者还可以使用抗焦虑和抗抑郁的药物。