呋喃妥因最常见的副作用包括胃肠道的症状，如恶心、呕吐、食欲差和腹泻等，还有可能会出现皮疹、药物热、粒细胞减少、肝炎等变态反应。如果有葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症者，还有可能会发生溶血性贫血。
在用药中有可能会出现神经系统的不良反应，偶然会出现头痛、头昏、嗜睡、肌痛、眼球震颤等，一般属于可逆性的，停药之后可以消失，严重者可以发生周围神经炎。呋喃妥因还有可能会引起患者出现咳嗽、胸痛、肺部侵润和嗜酸粒细胞增多等急性肺炎的表现，停药之后也可以迅速的消失。
如果长时间服药，超过六个月以上的患者，还有可能会出现间质性肺炎或者肺纤维化，应及早停药并采取相应的治疗措施。
在用药中有可能会出现神经系统的不良反应，偶然会出现头痛、头昏、嗜睡、肌痛、眼球震颤等，一般属于可逆性的，停药之后可以消失，严重者可以发生周围神经炎。呋喃妥因还有可能会引起患者出现咳嗽、胸痛、肺部侵润和嗜酸粒细胞增多等急性肺炎的表现，停药之后也可以迅速的消失。
如果长时间服药，超过六个月以上的患者，还有可能会出现间质性肺炎或者肺纤维化，应及早停药并采取相应的治疗措施。