颌骨囊肿分为感染性的囊肿,比方临床常见的根端囊肿,根端囊肿是由于牙髓神经发生感染、坏死,感染的物质通过根尖孔逐渐渗透到颌骨,引起的根尖区域颌骨的炎症性破坏,形成了囊肿。颌骨囊肿还有一部分是发育性的囊肿,包括鼻唇囊肿、切牙管囊肿等。这是由于在颌骨发育过程中,一些上皮组织被迷走到颌骨内,后来逐渐发育成囊性的病变。还有一类颌骨囊肿,它的发生是与牙齿的发育有关。在牙齿形成的过程中,各种参与牙齿发育的细胞,在牙齿形成以后应该正常的退化,如果这些细胞没有退化而遗留在颌骨内,就可能会发生囊肿,称为牙源性的颌骨囊肿。