隐斜视的病因和发病机制极为复杂，至今未完全阐明。一般认为是解剖结构异常、神经支配异常、调节集合失调、屈光异常以及遗传等引起，好发于屈光不正患者、儿童、有家族史者，容易因为感冒、发烧、惊吓、注意力不集中等诱发。
1、解剖因素：双眼的眼球、眼眶及其附属器官的形态、构造不完全正常并且不对称；眼外肌附着点及眼外肌其节制韧带、肌鞘、肌间膜出现异常等均可以引起隐斜视。或者角膜混浊、先天性白内障、玻璃体积血、脉络膜缺损、黄斑部缺损、屈光参差等所形成的感觉障碍因素，以及其他异常导致的运动性障碍或中枢性障碍，均可导致隐斜视。
2、神经支配异常：中枢神经系统兴奋性异常，如出现过量神经冲动、惊吓或强烈的精神刺激，则可以引起隐斜视。
3、调节集合失调：新生儿在出生后，因视敏度低看不清物体，睫状肌发育不全，不须用调节。当婴儿发育到2.5～3.5岁时看近或远处目标时使用调节力和辐辏，这种过程可导致内斜视，称调节性内斜视。一般来说，近视眼因少用调节，形成调节性外斜视。
4、遗传因素：隐斜视有遗传倾向，提示本病与遗传有相关性。
1、解剖因素：双眼的眼球、眼眶及其附属器官的形态、构造不完全正常并且不对称；眼外肌附着点及眼外肌其节制韧带、肌鞘、肌间膜出现异常等均可以引起隐斜视。或者角膜混浊、先天性白内障、玻璃体积血、脉络膜缺损、黄斑部缺损、屈光参差等所形成的感觉障碍因素，以及其他异常导致的运动性障碍或中枢性障碍，均可导致隐斜视。
2、神经支配异常：中枢神经系统兴奋性异常，如出现过量神经冲动、惊吓或强烈的精神刺激，则可以引起隐斜视。
3、调节集合失调：新生儿在出生后，因视敏度低看不清物体，睫状肌发育不全，不须用调节。当婴儿发育到2.5～3.5岁时看近或远处目标时使用调节力和辐辏，这种过程可导致内斜视，称调节性内斜视。一般来说，近视眼因少用调节，形成调节性外斜视。
4、遗传因素：隐斜视有遗传倾向，提示本病与遗传有相关性。