梅毒和疖子在病因和临床表现上都有显著不同，梅毒是由梅毒螺旋体感染所引起的性传播疾病，可以在皮肤上出现多种类型的皮肤损害，比如一期梅毒，主要是在外生殖器和肛门周围出现硬下疳，典型表现是硬结、溃疡，不痛、不痒。长在外阴部的疖肿主要是化脓性细菌感染所引起，都是毛囊性的丘疹、脓疱，有明显的红、肿、热、痛等症状，这和硬下疳有显著的不同。
到了二期梅毒，有各种各样的梅毒疹，其中有些丘疹性的脓疱性梅毒疹，有时候和普通的细菌性毛囊炎和小疖肿容易混淆。梅毒的皮疹特点，往往是在潮红的基底上出现小脓疱，可以形成深浅不等的溃疡，通常也是不痛、不痒的，这和普通的疖肿也有显著不同。当然最好的鉴别方法还是做梅毒抗体血清学的检测，如果抗体阳性，先还是考虑梅毒的可能。
到了二期梅毒，有各种各样的梅毒疹，其中有些丘疹性的脓疱性梅毒疹，有时候和普通的细菌性毛囊炎和小疖肿容易混淆。梅毒的皮疹特点，往往是在潮红的基底上出现小脓疱，可以形成深浅不等的溃疡，通常也是不痛、不痒的，这和普通的疖肿也有显著不同。当然最好的鉴别方法还是做梅毒抗体血清学的检测，如果抗体阳性，先还是考虑梅毒的可能。