肚子两边隐隐作痛，最常见的原因是胃肠功能紊乱，与生活饮食不规律、情绪波动、睡眠不佳、进食对胃肠道有刺激的食物，及药物等因素有关系。主要是因为支配胃肠道的植物神经功能障碍，导致胃肠道蠕动不协调，又出现阵发性腹部隐痛，同时或伴有大便次数、形态、性状都发生改变，常常表现为大便次数增多，或者便秘。出现这种情况，可以通过调节肠道的药物以及益生菌来进行治疗，必要时可以做胃镜和肠镜检查来排除器质性病变。
慢性胃炎也会导致肚子两边隐隐作痛的现象，主要是因为胃部的胃酸分泌增多，刺激胃黏膜，导致黏膜出现充血、肿胀，甚至糜烂，尤其是进餐之后，会导致腹部胀痛以及反酸、恶心等症状，这种情况可以通过胃镜检查来明确诊断。
消化系统的肿瘤性病变也会引起肚子两边隐隐作痛的现象，比如结肠肿瘤等，常常会伴有大便的性状改变，同时有便血等现象，多数人还会伴有体重明显下降、消瘦、纳差等症状。对于这种情况可以做腹部的CT，或者是胃肠镜检查来明确诊断。
慢性胃炎也会导致肚子两边隐隐作痛的现象，主要是因为胃部的胃酸分泌增多，刺激胃黏膜，导致黏膜出现充血、肿胀，甚至糜烂，尤其是进餐之后，会导致腹部胀痛以及反酸、恶心等症状，这种情况可以通过胃镜检查来明确诊断。
消化系统的肿瘤性病变也会引起肚子两边隐隐作痛的现象，比如结肠肿瘤等，常常会伴有大便的性状改变，同时有便血等现象，多数人还会伴有体重明显下降、消瘦、纳差等症状。对于这种情况可以做腹部的CT，或者是胃肠镜检查来明确诊断。