1、头颅CT：头颅CT表现为包膜可有或无增强，肉芽肿则呈等密度或略高密度病灶，中等增强，可有或无钙化，周围脑水肿常不明显。
2、脑脊液细胞学：脑脊液经细胞玻片离心后对沉淀物行MGG染色，可见成簇排列的圆形或卵圆形隐球菌菌体，呈蓝紫色，荚膜呈毛刺状，部分菌体可见芽孢生长。
3、脑脊液免疫学检查：乳胶凝集试验和酶联免疫吸附试验可直接检测隐球菌荚膜多糖抗原，具有简便、迅速、阳性率高的特点，在早期快速诊断中具有优势。但存在假阳性，系统性红斑狼疮和结节病等免疫疾病可出现乳胶凝集试验假阳性结果。
2、脑脊液细胞学：脑脊液经细胞玻片离心后对沉淀物行MGG染色，可见成簇排列的圆形或卵圆形隐球菌菌体，呈蓝紫色，荚膜呈毛刺状，部分菌体可见芽孢生长。
3、脑脊液免疫学检查：乳胶凝集试验和酶联免疫吸附试验可直接检测隐球菌荚膜多糖抗原，具有简便、迅速、阳性率高的特点，在早期快速诊断中具有优势。但存在假阳性，系统性红斑狼疮和结节病等免疫疾病可出现乳胶凝集试验假阳性结果。