舌咽神经痛按照发病原因，分为原发性和继发性两大类。
1、原发性舌咽神经痛：常常由于吞咽、说话或者打哈欠所诱发的疼痛。
2、继发性舌咽神经痛：由于恶性肿瘤或者全身性的炎症反应所导致的舌咽神经痛。
3、按疼痛的部位一般可分为2型：：
（1）口咽型：疼痛区始于咽侧壁、扁桃体、软腭及舌后1/3，而后放射到耳区，此型最为多见。
（2）耳型：疼痛区始于外耳、外耳道及乳突，或介于下颌角与乳突之间，很少放射到咽侧，此型少见。疼痛程度轻重不一，有如电击、刀割、针刺、发作短暂，间歇期由数分钟到数月不等，少数甚至长达2~3年。