甲胎蛋白与肝癌的关系比较密切，甲胎蛋白是肿瘤标志物中的一种，也是一种糖蛋白，在成人血液中含量比较低，其主要与肝癌相关，也是临床上应用为较为广泛的诊断肝癌的血液学指标，主要用于肝癌的辅助诊断、疗效监测，以及预后的判断。通常在原发性肝癌的患者中，会有60%-70%的患者出现甲胎蛋白的升高。除此之外，在肝炎、肝硬化或者生殖器官的恶性肿瘤，也会引起甲胎蛋白的不同程度的增高。
因此，肿瘤标志物的生物活性是会改变的，其敏感性和特异性并不是很高，只能作为临床的一个辅助性的诊断。甲胎蛋白的检测值高于正常值很多或异常增高，同时患者又有明显的临床症状时，例如肝脏有占位，这时推测患者可能会患有肝癌的可能，但是要想确切诊断，必须做穿刺活检病理检查或手术切除后病理检查，才能够给予明确的诊断，从而指导临床的治疗。
因此，肿瘤标志物的生物活性是会改变的，其敏感性和特异性并不是很高，只能作为临床的一个辅助性的诊断。甲胎蛋白的检测值高于正常值很多或异常增高，同时患者又有明显的临床症状时，例如肝脏有占位，这时推测患者可能会患有肝癌的可能，但是要想确切诊断，必须做穿刺活检病理检查或手术切除后病理检查，才能够给予明确的诊断，从而指导临床的治疗。