肩-手综合征的主病因包括卒中后早期迟缓性瘫痪、肌张力异常、肌张力异常、神经源性炎症及激发性外伤，常见于脑卒中患者，该疾病无诱发因素。
1、卒中后早期迟缓性瘫痪：卒中后早期迟缓性瘫痪时，肩关节半脱位占60%~80%，此时，肩胛骨周围肌肉瘫痪、痉挛，肩胛带结构失稳等导致肩关节半脱位，正常的无痛性手臂运动被破坏，造成肩袖损伤，肩关节稳定性下降或丧失，当患肢受到牵拉或过度外展外旋时，肩袖被撕裂而产生疼痛。
2、肌张力异常：肌张力的变化会对肩关节功能产生影响。肌张力增高后，肌肉痉挛引起肩关节僵硬，使肩胛骨的正常运动受限，使手臂固定于内旋位，此时在肌肉附着点处引起牵拉疼痛。而肌张力降低时，肩关节周围肌肉松弛，无法对肩关节起到有效支撑和保护作用，肩关节抵抗不了手臂重量或者康复运动时外力的牵拉，导致肩关节韧带和周围软组织过度拉伸损伤而引起肩痛。
3、交感神经功能障碍：脑卒中后肩-手综合征病人的临床表现与交感神经紊乱相关。脑卒中后脑实质受到严重损害，进而对交感神经造成了直接或者间接损害。
4、神经源性炎症：肩-手综合征早期因神经末梢缺血缺氧及炎性介质释放，存在局部 的神经源性炎症反应，然而确切机制不甚清楚。
5、继发性外伤：继发性外伤可引起局部组织水肿、肌无力及神经损伤，进而进一步导致局部的循环受限，最终导致肩-手综合征的发生。
1、卒中后早期迟缓性瘫痪：卒中后早期迟缓性瘫痪时，肩关节半脱位占60%~80%，此时，肩胛骨周围肌肉瘫痪、痉挛，肩胛带结构失稳等导致肩关节半脱位，正常的无痛性手臂运动被破坏，造成肩袖损伤，肩关节稳定性下降或丧失，当患肢受到牵拉或过度外展外旋时，肩袖被撕裂而产生疼痛。
2、肌张力异常：肌张力的变化会对肩关节功能产生影响。肌张力增高后，肌肉痉挛引起肩关节僵硬，使肩胛骨的正常运动受限，使手臂固定于内旋位，此时在肌肉附着点处引起牵拉疼痛。而肌张力降低时，肩关节周围肌肉松弛，无法对肩关节起到有效支撑和保护作用，肩关节抵抗不了手臂重量或者康复运动时外力的牵拉，导致肩关节韧带和周围软组织过度拉伸损伤而引起肩痛。
3、交感神经功能障碍：脑卒中后肩-手综合征病人的临床表现与交感神经紊乱相关。脑卒中后脑实质受到严重损害，进而对交感神经造成了直接或者间接损害。
4、神经源性炎症：肩-手综合征早期因神经末梢缺血缺氧及炎性介质释放，存在局部 的神经源性炎症反应，然而确切机制不甚清楚。
5、继发性外伤：继发性外伤可引起局部组织水肿、肌无力及神经损伤，进而进一步导致局部的循环受限，最终导致肩-手综合征的发生。