阿莫西林和阿奇霉素都属于抗菌药物，但是它们的抗菌谱、安全性是不同的。阿莫西林是一个青霉素类的抗菌药物，对常见的肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌等等，都有非常好的疗效，可以用于急性的上呼吸道感染。阿奇霉素也可以对肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌有效。
目前临床上由肺炎链球菌导致的上呼吸道感染，阿奇霉素的耐药率高达85%以上。如果确认是肺炎链球菌引起的社区获得性肺炎，或者急性的上呼吸道感染，是不会选择阿奇霉素的。但是阿奇霉素对非典型病原菌，像肺炎支原体、肺炎衣原体和嗜肺军团菌，还是有非常好的疗效，尤其是对儿童来说是可以选择的。阿莫西林对肺炎链球菌引起的感染作用非常强，但是它对非典型病原菌引起的感染，基本上是无效的。如果患者对青霉素过敏不能选择阿莫西林，如果患者有长QT间期，不能选择阿奇霉素，因为阿奇霉素可以导致QT间期的延长。这是它们的一点 点区别，包括它们针对的感染病原菌的活性和安全性。
目前临床上由肺炎链球菌导致的上呼吸道感染，阿奇霉素的耐药率高达85%以上。如果确认是肺炎链球菌引起的社区获得性肺炎，或者急性的上呼吸道感染，是不会选择阿奇霉素的。但是阿奇霉素对非典型病原菌，像肺炎支原体、肺炎衣原体和嗜肺军团菌，还是有非常好的疗效，尤其是对儿童来说是可以选择的。阿莫西林对肺炎链球菌引起的感染作用非常强，但是它对非典型病原菌引起的感染，基本上是无效的。如果患者对青霉素过敏不能选择阿莫西林，如果患者有长QT间期，不能选择阿奇霉素，因为阿奇霉素可以导致QT间期的延长。这是它们的一点 点区别，包括它们针对的感染病原菌的活性和安全性。